La terminal ro-pax, se encuentra situada en el denominado Muelle Sur, inaugurado por la Autoridad Portuaria a finales de 2004, con una clara vocación de albergar tráficos de carga general contenerizada y rodada, los cuales actualmente tienen lugar en sus instalaciones.

El muelle está situado en la parte más exterior de la Ría de Huelva, en zona muy próxima a la bocana lo que le confiere gran facilidad y rapidez de acceso y salida para los buques. Sus actuales 13 metros de calado en bajamar, que por características constructivas pueden ser ampliables a 15 m con un simple proceso de profundización, sin modificar su estructura, experimenta actualmente un proceso de ampliación de su línea de atraque que contempla una profundidad de 17 m. en bajamar, lo que permitirá el acceso de buques de mayor capacidad.

Junto a la Terminal Ropax se encuentra la terminal de ferrocarril, donde actualmente se reciben y expiden contenedores, no obstante, dicha terminal ferroviaria cuenta con un proyecto de Autopistas Ferrroviarias, que permitirá el transporte de trailers de camión sobre vagones, con el cual completará la operatividad plena de dicha terminal ferroviaria.

Estas dos terminales, ro-pax y ferroviaria, junto con la terminal de contenedores ubicada también en este muelle, conforman la Plataforma Logística del Muelle Sur, donde operan en la actualidad navieras como Containerships, Alisios Shipping Lines, ARMAS – Trasmediterránea, Baleària, Fred. Olsen Express, entre otras, que gestionan fundamentalmente líneas regulares con el norte de Europa y las Islas Canarias.